Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDDC3Q8N4P3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDDC3Q8N4P3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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