Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM48Q8IWZ4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM48Q8IWZ4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms