Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ATG4DQ86TL0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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