Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms