Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TCF23Q7RTU1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms