Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms