Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms