Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC2DQ5SRD0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms