Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BOLA3Q53S33 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms