Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HSD17B12Q53GQ0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms