Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms