Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms