Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CNGA3Q16281 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CNGA3Q16281 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CNGA3Q16281 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CNGA3Q16281 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CNGA3Q16281 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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CNGA3Q16281 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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CNGA3Q16281 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNGA3Q16281 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms