Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZFHX3Q15911 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms