Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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