Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EEA1Q15075 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
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