Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms