Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms