Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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