Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CNGB1Q14028 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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CNGB1Q14028 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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CNGB1Q14028 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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CNGB1Q14028 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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CNGB1Q14028 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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CNGB1Q14028 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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CNGB1Q14028 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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CNGB1Q14028 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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CNGB1Q14028 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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CNGB1Q14028 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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CNGB1Q14028 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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CNGB1Q14028 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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