Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H3Q13889 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms