Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PKP1Q13835 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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