Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGA9Q13797 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGA9Q13797 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGA9Q13797 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGA9Q13797 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGA9Q13797 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGA9Q13797 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGA9Q13797 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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ITGA9Q13797 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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ITGA9Q13797 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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ITGA9Q13797 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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