Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms