Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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CUL1Q13616 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CUL1Q13616 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CUL1Q13616 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CUL1Q13616 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CUL1Q13616 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CUL1Q13616 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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CUL1Q13616 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL1Q13616 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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