Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MTMR3Q13615 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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