Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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