Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC131097.1-201ENST00000437438 739 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC131934.1-201ENST00000527799 912 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC084759.2-202ENST00000557976 1053 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC010976.1-201ENST00000631170 734 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC007228.2-201ENST00000602145 1328 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LLPH-202ENST00000446587 1177 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 NSMCE2-208ENST00000520866 1183 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SATB1-AS1-242ENST00000627496 807 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms