Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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