Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN3Q13064 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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