Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STRN3Q13033 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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