Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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