Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms