Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms