Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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