Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC20Q12834 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC20Q12834 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms