Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms