Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK18Q07002 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms