Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms