Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LTBQ06643 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LTBQ06643 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LTBQ06643 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LTBQ06643 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LTBQ06643 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LTBQ06643 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LTBQ06643 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LTBQ06643 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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LTBQ06643 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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LTBQ06643 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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LTBQ06643 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LTBQ06643 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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