Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC109635.4-201ENST00000636653 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LYG1-201ENST00000308528 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 BCAS2P3-201ENST00000416374 767 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC013452.2-201ENST00000557910 743 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC079598.2-201ENST00000599191 1294 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms