Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms