Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms