Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SSBP1Q04837 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms