Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms