Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms