Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms