Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IDH3AP50213 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms