Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PXNP49023 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PXNP49023 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXNP49023 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXNP49023 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXNP49023 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXNP49023 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXNP49023 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXNP49023 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXNP49023 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXNP49023 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PXNP49023 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PXNP49023 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXNP49023 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXNP49023 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXNP49023 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PXNP49023 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms