Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARL1P40616 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARL1P40616 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms